La ganadería puede coexistir, en pequeña escala y sin relación con la deforestación, legal o ilegal, si se desarrolla adaptando prácticas de eficiencia productiva, o en sistemas agroforestales o de Integración Cultivo-Ganadería-Bosque. Además, debe considerar que la mano de obra sea local y sea remunerada en forma justa y respetando los derechos territoriales de los pueblos y comunidades amazónicos. Por otro lado, el modelo sustentable, en comparación con los actuales, contribuyen a la reducción de impactos ambientales negativos, como las emisiones de gases de efecto invernadero (GEI) a la atmósfera.

La ganadería no sustentable creció rápidamente en la Amazonía, estimulada por las políticas gubernamentales y la demanda del mercado. Como consecuencia, la deforestación, ligada a ese y otros factores, es uno de los principales problemas socioambientales de Brasil y del mundo. Además de la deforestación, la destrucción de la Amazonía trae aparejado un aumento de incendios, conflictos con los pueblos originarios y acaparamiento de tierras.

La deforestación del bosque más biodiverso del mundo para realizar agricultura, especialmente el monocultivo de soja, es otra amenaza importante para la región y ha aumentado exponencialmente. Los cultivos amenazan la permanencia de las especies por la pérdida de hábitat, el uso intensivo de pesticidas -que también contaminan el suelo y el agua. Por otro lado, la expansión de los monocultivos también genera conflictos territoriales y violaciones de los derechos de los pueblos y poblaciones tradicionales, así como la pérdida de especies culturalmente relevantes en la región.

La construcción de obras de infraestructura como carreteras mal planificadas que solo benefician a los grandes productores, centrales hidroeléctricas y minas para la extracción de minerales y oro, especialmente las ilegales, amenazan la vida de personas y especies de la selva amazónica, provocando la contaminación de aguas y suelos, conflictos y vulneración de derechos, provocando brotes de enfermedades, desconectando hábitats para especies y dificultando y muchas veces imposibilitando el mantenimiento de la forma de vida de las personas que habitan estos territorios.